On paljon laitosten korkeakoulutuksen kaikkialla Kirgisiassa. Tämä sisältää noin kolmekymmentä seitsemän julkisia yliopistoja ja kahdeksantoista yksityisiä yliopistoja. Keskeiset yliopistojen Kirgisia kuuluu University Keski-Aasian ja Kirgisian kansallinen yliopisto.

Luonnontieteiden kandidaatin tutkinnon (BSc eli Bachelor of Science) voi suorittaa akateemisissa oppilaitoksissa ympäri maailmaa. Tämä suosittu perustutkinto valmistaa opiskelijoita työelämään ja myös jatko-opintojen suorittamiseen. BSc-tutkinnon suorittaminen kestää yleensä 3 - 5 vuotta.